Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Anders Blomberg

Professor

Anders Blomberg
Professor
Akademisk grad: Docent,
anders.blomberg@cmb.gu.se
0733-604624

Postadress: Box 462, 40530 Göteborg
Besöksadress: Medicinaregatan 9 c , 41390 Göteborg


Institutionen för kemi och molekylärbiologi (Mer information)
Box 462
405 30 Göteborg
www.cmb.gu.se
inst.kmb@cmb.gu.se
Fax: 031-786 2599

Besöksadress: Medicinaregatan 9 C , 405 30 Göteborg

Om Anders Blomberg

Anders Blomberg disputerade i mikrobiologi 1988 på en avhandling med titeln "Osmoregulation and Osmotolerance in yeast". Han har sedan 2002 en tjänst som professor i funktionsgenomik vid Göteborgs universitet. Han var under 2001 - 2008 program-chef för den svenska nationella Forskarskolan i genomik och bioinformatik. Blomberg är sedan 2010 vice koordinator för Centrum för marin evolutionsbiologi (CEMEB) vid universitetet. Han har publicerat 83 publikationer i internationella tidskrifter och 14 översiktsartiklar/bok-kapitel. Blomberg driver en forskargrupp på cirka 10 medlemmar som består av 2 doktorander (har tidigare handlett totalt 10 doktorander), 7 post-docs/forskare och flera master’s-studenter.

Forskargrupp (2016/03/18): Ulrika Lind (forskare), Magnus Alm Rosenblad (forskare), Mats Töpel (forskare), Luciano Fernandez-Ricaud (forskare), Peter Dahl (forskare), Tomas Larsson (post-doc) Valeria Wallace (post-doc), Martin Zackrisson (doktorand), Anna Abramova (doktorand), Emil Karlsson (master’s-student), Sabiha Amir (master’s-student), Esteban Fernandez Parada (master’s-student), Tarek Elhasi (master’s-student), Merce Montoliu master’s-student).

Länk till webbplatsen för gruppen (under uppbyggnad).

Publikation Google Scholar: scholar.google.se/citations
 

FORSKNING

Forskningen i Blombergs grupp löper längs fyra huvudspår:

i) Osmoregulatoriska mekanismer hos eukaryoter
Blomberg har under lång tid använt genom-vida tekniker, t.ex. proteomik och fenomik, på jästsvampen Sacchaomyces cerevisiae för att karakterisera dess saltinducerade stressrespons och osmoregulatoriska mekanismer. Detta har resulterat i identifiering av gener involverade i osmolyten glycerol’s produktion och ackumulering (GPD1, GPP2), visat på vikten av N-terminal acetyleringar för specifika stressproteiner (TFS1) och gett en molekylär förståelse av saltstress-inducerad dihydroxiaceton-toxicitet (DAK1). Vi har också på senare tid inlett undersökningar av gener som är viktiga i osmoregulering i havstulpanen Balanus improvisus, via studier av t.ex. den primära transportören Na+/K+ ATPas, aquaporiner och prolin biosyntetiska komponenter. Salthalt-kontrollerade gener vid låg salthalt i B. improvisus har undersökts via RNA-sekvensering och heterologt uttryck i jäst för funktionell karakterisering. Vi genomför också populations-genomik och populations-fenomik studier på den mycket salttoleranta marina jästsvampen Debaryomyces hansenii.

Utvalda publikationer:
Lind, U., Alm Rosenblad, M., Wrange, A.-L., Sundell, K.S., Jonsson, P.R., André, C., Havenhand, J., Blomberg, A.
Molecular characterization of the α-subunit of Na+/K+ ATPase from the euryhaline barnacle Balanus improvisus reveals multiple genes and differential expression of alternative splice variants
PLoS One, (2013) 8:e77069

Logg, K., Warringer, J., Hashemi, S. H., Käll, M., and Blomberg, A.
The sodium pump Ena1p provides mechanistic insight into the salt sensitivity of vacuolar sorting mutants
BBA –Molecular Cell Research (2008) 1783:974

ii) Fenomik - storskalig fenotypisk profilering
Fenotypisk profilering av genetiskt definierade stammar, t.ex. specifika gen-deletioner eller fullt sekvenserade naturliga isolat, är nödvändigt för att få en förståelse av relationen mellan genotyp och fenotyp. Vi utvecklar metodik för storskalig hög-upplöst fenotypning av mikrobiell tillväxt. Våra system möjliggör analys av upp till 100,000 mutanter/stammar per vecka baserat på automatiserad odling och mätning, i kombination med robust statistik och extraktion av tillväxtegenskaper. I olika samarbeten har vi också utvecklat och karakteriserat genetiskt manipulerade stammar. Den fenotypiska informationen finns tillgänglig på vår fenomik-databas PROPHECY.

Utvalda publikationer:
Liti, L., Carter, D., Moses, Warringer, J, A., Parts., L., James, S.A., Robert, P.D., Roberts, I.N., Burt, A., Koufopanou, V., Tsai, I.J., Bergman, B., Bensasson, D., O’Kelly, M.J.T., von Oudenaarden, A., Barton, D.B.H., Bailes, E.,Nguyen, A.N., Jones, M., Qual, M.A., Goodhead, I., Sims, S., Smith, F., Blomberg, A., Durbin, R., and Louis, E.J.
Population genomics of domestic and wild yeasts.
Nature (2009) 458:337

Warringer J, Zörgö E, Cubillos FA, Zia A, Gjuvsland A, Simpson JT, Forsmark A, Durbin R, Omholt SW, Louis EJ, Liti G, Moses A, Blomberg A.
Trait variation in yeast is defined by population history
PLoS Genetics (2011) 7:e1002111


iii) Marin bioteknik
Blomberg är involverad i flera projekt inom marin bioteknik: i) Studier av mekanismer för att motverka påväxt i marin miljö (båtbottenfärg), med tonvikt på molekylära studier av havstulpan Balanus improvisus som är huvudsakliga boifouling-organismen på fartygsskrov och konstruktioner i nord-europeiska vatten. Dessa undersökningar har lett till identifiering och karakterisering av fem octopamine receptorer som är involverade i avkänning av det påväxthindrande ämnet medetomidin. ii) Proteomik-analys av komponenter i slem hos pirålen Myxine glutinosa för tillämpningar inom biomedicin. iii) Analys av havstulpanens cementproteiner för utveckling av undervattens-lim. iv) Utforskning av nya marina ämnen och via kemiska-genetiska high-throughput analyser få en uppfattning om ämnenas mode-of-action.

Utvald publikation:
Ulrika Lind, Magnus Alm Rosenblad, Linda Hasselberg Frank, Susanna Falkbring, Lars Brive, Jonne M Laurila, Katariina Pohjanoksa, Anne Vuorenpää; Jyrki P. Kukkonen Lina Gunnarsson, Mika Scheinin, Lena G.E. Mårtensson Lindblad and Anders Blomberg.
Octopamine receptors from the barnacle Balanus improvisus are activated by the α2-adrenoceptor agonist medetomidine.
Molecular Pharmacology (2010) 78:237


iv) Genom-sekvensering av marina nyckelarter på den svenska västkusten.
Gruppen leder 8 genomsekvenseringsprojekt för marina organismer som finns längs den svenska västkusten. Denna verksamhet är en del av CEMEB (delprojektet IMAGO) i syfte att utveckla ett antal marina nyckel organismer inom ekologi och marin bioteknik till kraftfulla genetiska modellsystem.


UNDERVISNING

- Bioinformatik och funktionsgenomik, 15hec (BIO210)
- Avancerad funktionsgenomik, 15hec (BIO406)
- Läkemedelsutveckling, 7,5hp (BIO523)
- Cellbiologi, genetik och tillämpningar av molekylärbiologiska metoder, 7,5hp (MAR104)
- Kursansvarig: Bioinformatik och funktionsgenomik, 15hps (BIO210) (2000 - nuvarande)
- Kursansvarig: Avancerade funktionsgenomik, 15hp (BIO406) (2012- närvarande)
- Programchef för masterprogrammet i genomik och systembiologi (2012 - nuvarande)


FÖRTROENDEUPPDRAG

- Vice föreståndare för Centrum för marina evolutionsbiologi (2010 - nuvarande) (Univ i Göteborg.)
- Medlem i Scientific Advisory Board för jäst-databasen Saccharomyces Genome Database (SGD) vid Stanford Universitet, USA (2006 - nuvarande)
- Editorial board för FEMS Yeast Research (2007 - nuvarande)
- Editorial board för Microbial Cell (2013 - nuvarande)
- Medlem i organisationskommittén för det internationella Yeast Genetics mötet (2008- 2013)
- Medlem av utvärderingskommittén för Svenska Vetenskapsrådet (2011 och 2012)
- Ordförande för utvärdering av högre biologisk grundutbildning i Sverige (HSV / Uka) (2012)
- Ordförande för utvärdering av European Science Foundation för den europeiska rymdorganisationens (ESA) programmet (2009)
- Programchef för svenska nationella forskarskolan i genomik och bioinformatik (2002 - 2008)

 

Senaste publikationer

The mitochondrial genome sequences of the round goby and the sand goby reveal patterns of recent evolution in gobiid fish
Irene Adrian-Kalchhauser, Ola Svensson, Verena E. Kutschera, Magnus Alm Rosenblad, Martin Pippel et al.
BMC Genomics, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2017
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Scan-o-matic: High-Resolution Microbial Phenomics at a Massive Scale
Martin Zackrisson, Johan Hallin, Lars-Göran Ottosson, Peter Dahl, Esteban Fernandez-Parada et al.
G3: Genes, Genomes, Genetics, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2016
Artikel i vetenskaplig tidskrift

DNA Extraction Protocols for Whole-Genome Sequencing in Marine Organisms
Marina Panova, Henrik Aronsson, R. Andrew Cameron, Peter Dahl, Anna Godhe et al.
Marine Genomics: Methods and Protocols, New York, NY, Springer New York, Kapitel i bok 2016
Kapitel i bok

Structures, Properties, and Dynamics of Intermediates in eEF2-Diphthamide Biosynthesis
Jean-Marc Billod, Patricia Saenz-Mendez, Anders Blomberg, Leif A Eriksson
Journal of Chemical Information and Modeling, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2016
Artikel i vetenskaplig tidskrift

PRECOG: a tool for automated extraction and visualization of fitness components in microbial growth phenomics
Luciano Fernandez-Ricaud, Olga Kourtchenko, Martin Zackrisson, Jonas Warringer, Anders Blomberg
Bmc Bioinformatics, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2016
Artikel i vetenskaplig tidskrift

The Skeletonema marinoi genome project
Mats H. Töpel, Sylvie V M Tesson, Magnus Alm Rosenblad, Tomas Larsson, Alvar Almstedt et al.
EMBO: Molecular life of Diatoms. 7-10 July, Seattle, USA, Poster (konferens) 2015
Poster (konferens)

Budding Yeast Strains and Genotype-Phenotype mapping
G Liti, Jonas Warringer, Anders Blomberg
CSHL protocol series “Budding Yeast: A Laboratory Manual”, Kapitel i bok 2015
Kapitel i bok

Concerted Evolution of Life Stage Performances Signals Recent Selection on Yeast Nitrogen Use.
Sebastian Ibstedt, Simon Stenberg, Sara Bagés, Arne B Gjuvsland, Francisco Salinas et al.
Molecular biology and evolution, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2015
Artikel i vetenskaplig tidskrift

High-throughput biochemical fingerprinting of Saccharomyces cerevisiae by Fourier transform infrared spectroscopy
A. Kohler, U. Böcker, V. Shapaval, Annabelle Forsmark, Mats X. Andersson et al.
PLoS ONE, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2015
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Visar 1 - 10 av 70

2017

The mitochondrial genome sequences of the round goby and the sand goby reveal patterns of recent evolution in gobiid fish
Irene Adrian-Kalchhauser, Ola Svensson, Verena E. Kutschera, Magnus Alm Rosenblad, Martin Pippel et al.
BMC Genomics, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2017
Artikel i vetenskaplig tidskrift

2016

Scan-o-matic: High-Resolution Microbial Phenomics at a Massive Scale
Martin Zackrisson, Johan Hallin, Lars-Göran Ottosson, Peter Dahl, Esteban Fernandez-Parada et al.
G3: Genes, Genomes, Genetics, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2016
Artikel i vetenskaplig tidskrift

DNA Extraction Protocols for Whole-Genome Sequencing in Marine Organisms
Marina Panova, Henrik Aronsson, R. Andrew Cameron, Peter Dahl, Anna Godhe et al.
Marine Genomics: Methods and Protocols, New York, NY, Springer New York, Kapitel i bok 2016
Kapitel i bok

Structures, Properties, and Dynamics of Intermediates in eEF2-Diphthamide Biosynthesis
Jean-Marc Billod, Patricia Saenz-Mendez, Anders Blomberg, Leif A Eriksson
Journal of Chemical Information and Modeling, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2016
Artikel i vetenskaplig tidskrift

PRECOG: a tool for automated extraction and visualization of fitness components in microbial growth phenomics
Luciano Fernandez-Ricaud, Olga Kourtchenko, Martin Zackrisson, Jonas Warringer, Anders Blomberg
Bmc Bioinformatics, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2016
Artikel i vetenskaplig tidskrift

2015

The Skeletonema marinoi genome project
Mats H. Töpel, Sylvie V M Tesson, Magnus Alm Rosenblad, Tomas Larsson, Alvar Almstedt et al.
EMBO: Molecular life of Diatoms. 7-10 July, Seattle, USA, Poster (konferens) 2015
Poster (konferens)

Budding Yeast Strains and Genotype-Phenotype mapping
G Liti, Jonas Warringer, Anders Blomberg
CSHL protocol series “Budding Yeast: A Laboratory Manual”, Kapitel i bok 2015
Kapitel i bok

Concerted Evolution of Life Stage Performances Signals Recent Selection on Yeast Nitrogen Use.
Sebastian Ibstedt, Simon Stenberg, Sara Bagés, Arne B Gjuvsland, Francisco Salinas et al.
Molecular biology and evolution, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2015
Artikel i vetenskaplig tidskrift

High-throughput biochemical fingerprinting of Saccharomyces cerevisiae by Fourier transform infrared spectroscopy
A. Kohler, U. Böcker, V. Shapaval, Annabelle Forsmark, Mats X. Andersson et al.
PLoS ONE, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2015
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Visar 1 - 10 av 70

Sidansvarig: Katleen Burm|Sidan uppdaterades: 2016-06-20
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?