Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Anders Blomberg

Professor

Anders Blomberg
Professor
Akademisk grad: Docent,
anders.blomberg@cmb.gu.se
0733-604624

Postadress: Box 462, 40530 Göteborg
Besöksadress: Medicinaregatan 9 c , 41390 Göteborg


Institutionen för kemi och molekylärbiologi (Mer information)
Box 462
405 30 Göteborg
www.cmb.gu.se
inst.kmb@cmb.gu.se
Fax: 031-786 2599
Besöksadress: Medicinaregatan 9 C , 413 90 Göteborg

Om Anders Blomberg

KORT CV
Anders Blomberg disputerade i mikrobiologi 1988 på en avhandling med titeln "Osmoregulation and Osmotolerance in yeast". Han har sedan 2002 en tjänst som professor i Funktionsgenomik vid Göteborgs universitet. Han var under åren 2001 - 2008 program-chef för den svenska nationella Forskarskolan i genomik och bioinformatik. Blomberg är sedan 2010 vice koordinator för Centrum för marin evolutionsbiologi (CEMEB) vid universitetet. Han har publicerat 95 primär-publikationer i internationella tidskrifter och 15 översiktsartiklar/bok-kapitel (h-index 41; antal citeringar 7600). Blomberg driver en forskargrupp på 7 - 10 personer, och har totalt varit huvud-handledare för 13 doktorander och 17 post-docs.

FORSKARGRUPP (2019-11-25)
Ulrika Lind (forskare), Magnus Alm Rosenblad (forskare), Anna Abramova (post-doc), Vaskar Mukherjee (post-doc, delad med Chalmers), Ashraful Alam (master’s-student), Sameh az Aldeen (master’s-student)


FORSKNING
Forskningen i Blombergs grupp löper längs fyra huvudspår:

i) Osmoregulatoriska mekanismer hos eukaryoter
Blomberg har under lång tid använt genom-vida tekniker, t.ex. proteomik och fenomik, på jästsvampen Sacchaomyces cerevisiae för att studera salt-stress och osmoregulatoriska mekanismer. Dessa studier har resulterat i identifiering av gener involverade i produktionen av osmolyten glycerol (GPD1, GPP2), visat på vikten av N-terminal acetylering för specifika stressproteiner (TFS1) och gett en molekylär förståelse av saltstress-inducerad dihydroxiaceton-toxicitet (DAK1). Vi har också på senare tid inlett undersökningar av gener som är viktiga i osmoregulering i havstulpanen Balanus improvisus, via studier av t.ex. den primära transportören Na+/K+ ATPas, aquaporiner och prolin biosyntetiska komponenter. Salt-kontrollerade gener i B. improvisus har undersökts via RNA-sekvensering och heterologt uttryck i jäst för funktionell karakterisering. Vi genomför också populations-genomik och populations-fenomik studier på den extremt salt-toleranta marina jästsvampen Debaryomyces hansenii.

Utvalda publikationer:
Lind, U., M. Järvå, M. Alm Rosenblad, P. Pingitore, E. Karlsson, A.-L. Wrange, E. Kamdal, K. Sundell, C. André, P. R. Jonsson, J. Havenhand, L. A. Eriksson, K. Hedfalk, A. Blomberg
Analysis of aquaporins from the euryhaline barnacle Balanus improvisus reveals differential expression in response to changes in salinity.
PLoS One, (2017) 12:e0181192

Lind, U., Alm Rosenblad, M., Wrange, A.-L., Sundell, K.S., Jonsson, P.R., André, C., Havenhand, J., Blomberg, A.
Molecular characterization of the α-subunit of Na+/K+ ATPase from the euryhaline barnacle Balanus improvisus reveals multiple genes and differential expression of alternative splice variants
PLoS One, (2013) 8:e77069

ii) Fenomik - storskalig fenotypisk profilering
Fenotypisk profilering av genetiskt definierade stammar, t.ex. specifika gen-deletioner eller fullt sekvenserade naturliga isolat, är nödvändigt för att få en förståelse av relationen mellan genotyp och fenotyp. Vi utvecklar metodik för storskalig hög-upplöst fenotypning av mikrobiell tillväxt. Våra system möjliggör analys av upp till 100,000 mutanter/stammar per vecka baserat på automatiserad odling och mätning, i kombination med robust statistik och extraktion av tillväxtegenskaper. I olika samarbeten har vi också utvecklat och karakteriserat genetiskt manipulerade stammar. Den fenotypiska informationen finns tillgänglig på vår fenomik-databas PROPHECY.

Utvalda publikationer:
Zackrisson, M., J. Hallin, L-G Ottosson, P. Dahl, E. Fernandez-Parada, E. Ländström, L. Fernandez-Ricaud, P. Kaferle, A. Skyman, S. Omholt, U. Petrovic, J. Warringer, A. Blomberg
Scan-o-matic: high-resolution microbial phenomics at a massive scale
G3: Genes, Genomes, Genetics, (2016) 6:3003

Warringer J, Zörgö E, Cubillos FA, Zia A, Gjuvsland A, Simpson JT, Forsmark A, Durbin R, Omholt SW, Louis EJ, Liti G, Moses A, Blomberg A.
Trait variation in yeast is defined by population history
PLoS Genetics (2011) 7:e1002111

Liti, L., Carter, D., Moses, Warringer, J, A., Parts., L., James, S.A., Robert, P.D., Roberts, I.N., Burt, A., Koufopanou, V., Tsai, I.J., Bergman, B., Bensasson, D., O’Kelly, M.J.T., von Oudenaarden, A., Barton, D.B.H., Bailes, E.,Nguyen, A.N., Jones, M., Qual, M.A., Goodhead, I., Sims, S., Smith, F., Blomberg, A., Durbin, R., and Louis, E.J.
Population genomics of domestic and wild yeasts.
Nature (2009) 458:337

iii) Marin bioteknik
Blomberg är involverad i flera projekt inom marin bioteknik: i) Studier av mekanismer för att motverka påväxt i marin miljö (båtbottenfärg), med tonvikt på molekylära studier av havstulpan Balanus improvisus som är huvudsakliga boifouling-organismen på fartygsskrov och konstruktioner i europeiska vatten. Dessa undersökningar har lett till identifiering och karakterisering av fem octopamine receptorer som är involverade i avkänning av det påväxt-hindrande ämnet medetomidin (säljs under namnet "Selectope". ii) Proteomik-analys för identifikation av komponenter i slem hos pirålen Myxine glutinosa för tillämpningar inom biomedicin. iii) Analys av havstulpanens cementproteiner för utveckling av undervattens-lim. iv) Utforskning av nya marina ämnen via kemiska-genetiska high-throughput analyser för få en uppfattning om ämnenas mode-of-action.

Utvald publikationer:
Abramova, A., Lind U., Blomberg A., Alm Rosenblad M
The complex barnacle perfume: Identification of waterborne pheromone homologues in Balanus improvisus and their differential expression during settlement
Biofouling, (2019) 35:416

Ulrika Lind, Magnus Alm Rosenblad, Linda Hasselberg Frank, Susanna Falkbring, Lars Brive, Jonne M Laurila, Katariina Pohjanoksa, Anne Vuorenpää; Jyrki P. Kukkonen Lina Gunnarsson, Mika Scheinin, Lena G.E. Mårtensson Lindblad and Anders Blomberg.
Octopamine receptors from the barnacle Balanus improvisus are activated by the α2-adrenoceptor agonist medetomidine.
Molecular Pharmacology (2010) 78:237

iv) Genom-sekvensering av havstulpanen Balanus improvisus
Gruppen har varit inblandade i ett antal genom-sekvenseringsprojekt för marina organismer som finns längs den svenska västkusten, med syftet att utveckla ett antal marina nyckel-arter inom ekologi och marin bioteknik till kraftfulla genetiska modellsystem. Framför allt drivs projekt kring att ta fram ett bra referens-genom för havstulpanen Balanus improvisus.

Utvald publikation:
Alm Rosenblad, M., Abramova, A., Lind, U., Ólason, P., Giacomello,S., Nystedt, B., Blomberg, A.
A pilot study for the sequencing of the barnacle Balanus improvisus genome reveals extreme genetic diversity
To be submitted


UNDERVISNING
- Bioinformatik och funktionsgenomik, 15hec (BIO210)
- Avancerad funktionsgenomik, 15hec (BIO406)
- Läkemedelsutveckling, 7,5hp (BIO523)
- Kursansvarig: Bioinformatik och funktionsgenomik, 15hps (BIO210) (sedan 2000)
- Kursansvarig: Avancerade funktionsgenomik, 15hp (BIO406) (sedan 2012)
- Programchef för master's-programmet i genomik och systembiologi (sedan 2012)


FÖRTROENDEUPPDRAG
- Vice föreståndare för Centrum för marina evolutionsbiologi (sedan 2010) (Göteborgs universitet.)
- Medlem i Scientific Advisory Board för jäst-databasen Saccharomyces Genome Database (SGD) vid Stanford Universitet, USA (2006 - 2017)
- Editorial board för FEMS Yeast Research (sedan 2007)
- Editorial board för Microbial Cell (sedan 2013)
- Medlem i organisationskommittén för det internationella Yeast Genetics mötet (2008- 2013)
- Medlem av utvärderingskommittén för Svenska Vetenskapsrådet (2011 och 2012)
- Ordförande för utvärdering av högre biologisk grundutbildning i Sverige (HSV / Uka) (2012)
- Ordförande för utvärdering av European Science Foundation för den europeiska rymdorganisationens (ESA) programmet (2009)
- Programchef för svenska nationella forskarskolan i genomik och bioinformatik (2002 - 2008)
 

Senaste publikationer

Integrins in disguise - mechanosensors in Saccharomyces cerevisiae as functional integrin analogues
Tarek Elhasi, Anders Blomberg
Microbial Cell, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2019
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Clines on the seashore: The genomic architecture underlying rapid divergence in the face of gene flow
A. M. Westram, Marina Rafajlovic, P. Chaube, R. Faria, Tomas Larsson et al.
Evolution Letters, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2018
Artikel i vetenskaplig tidskrift

The Barnacle Balanus improvisus as a Marine Model - Culturing and Gene Expression
Per R. Jonsson, A. L. Wrange, Ulrika Lind, Anna Abramova, Martin Ogemark et al.
Jove-Journal of Visualized Experiments, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2018
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Optimization of a high-throughput phenotyping method for chain-forming phytoplankton species
Susanna Gross, Olga Kourtchenko, Tuomas Rajala, Björn Andersson, Luciano Francisco Fernandez Ricaud et al.
Limnology and Oceanography : Methods, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2018
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Mapping quantitative trait loci in yeast
G. Liti, Jonas Warringer, Anders Blomberg
Cold Spring Harbor Protocols, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2017
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Visar 11 - 20 av 82

2017

Isolation and laboratory domestication of natural yeast strain
G. Liti, Jonas Warringer, Anders Blomberg
Cold Spring Harbor Protocols, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2017
Artikel i vetenskaplig tidskrift

Yeast reciprocal hemizygosity to confirm the causality of a quantitative trait loci-associated gene
Jonas Warringer, G. Liti, Anders Blomberg
Cold Spring Harbor Protocols, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2017
Artikel i vetenskaplig tidskrift

The mitochondrial genome sequences of the round goby and the sand goby reveal patterns of recent evolution in gobiid fish
Irene Adrian-Kalchhauser, Ola Svensson, Verena E. Kutschera, Magnus Alm Rosenblad, Martin Pippel et al.
BMC Genomics, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2017
Artikel i vetenskaplig tidskrift

2016

Scan-o-matic: High-Resolution Microbial Phenomics at a Massive Scale
Martin Zackrisson, Johan Hallin, Lars-Göran Ottosson, Peter Dahl, Esteban Fernandez-Parada et al.
G3: Genes, Genomes, Genetics, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2016
Artikel i vetenskaplig tidskrift

DNA Extraction Protocols for Whole-Genome Sequencing in Marine Organisms
Marina Panova, Henrik Aronsson, R. Andrew Cameron, Peter Dahl, Anna Godhe et al.
Marine Genomics: Methods and Protocols, New York, NY, Springer New York, Kapitel i bok 2016
Kapitel i bok

Structures, Properties, and Dynamics of Intermediates in eEF2-Diphthamide Biosynthesis
Jean-Marc Billod, Patricia Saenz-Mendez, Anders Blomberg, Leif A Eriksson
Journal of Chemical Information and Modeling, Artikel i vetenskaplig tidskrift 2016
Artikel i vetenskaplig tidskrift

2015

Budding Yeast Strains and Genotype-Phenotype mapping
G Liti, Jonas Warringer, Anders Blomberg
CSHL protocol series “Budding Yeast: A Laboratory Manual”, Kapitel i bok 2015
Kapitel i bok

The Skeletonema marinoi genome project
Mats H. Töpel, Sylvie V M Tesson, Magnus Alm Rosenblad, Tomas Larsson, Alvar Almstedt et al.
EMBO: Molecular life of Diatoms. 7-10 July, Seattle, USA, Poster (konferens) 2015
Poster (konferens)

Visar 11 - 20 av 82

Sidansvarig: Katleen Burm|Sidan uppdaterades: 2016-06-20
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?